這些贈款的本意是給以孫中山為首的同盟會革命組織，可是孫中山只告知了同盟會鈴木久五郎的一萬日元贈款，隱瞞了日本政府的贈款。他只把兩千日元留給《民報》作經費，自己帶走其余全部贈款。

　　孫中山離去后，日本政府透露曾向孫中山贈款一事，在同盟會東京本部引起一片嘩然。很多同盟會成員認為孫中山私受日本政府的贈款，是被日本人收買了，有損同盟會的聲譽。章太炎、張繼、劉師培等人更是發(fā)起了旨在撤消其總理頭銜的“倒孫運動”。章太炎稱孫中山這種做法“實在有損我同盟會之威信，而使日人啟其輕侮之心”。他撕下掛在《民報》報社的孫中山相片，寫上“賣《民報》之孫文應立即撤去”，拍成照片郵寄給孫中山。接著他和陶成章發(fā)表《偽〈民報〉檢舉狀》，印成傳單散發(fā)：“孫文懷挾巨資，而用之公務者十不及一。《民報》所求補助，無過三四千，亦不為籌畫，其干莫可知也�！睆埨^的批評更加激烈：“革命之前，必先革革命黨之命�！薄巴�孫派”劉揆一則認為，總理將剩下的錢全部給了潮惠起義人員以應黨需，他一向以實行革命為要務，絕不會居總理之虛名。雙方鬧得不可開交，甚至大打出手。

　　最后，同盟會二號人物黃興，提出顧全大局，才化解了這場風波，這就是所謂的“贈款門”事件。